4月21日,科技日?qǐng)?bào)記者從中國(guó)科學(xué)院青島生物能源與過(guò)程研究所(以下簡(jiǎn)稱“青島能源所”)獲悉,該所單細(xì)胞中心聯(lián)合清華大學(xué)、中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院等單位,創(chuàng)新性地將過(guò)程拉曼組技術(shù)引入發(fā)酵過(guò)程監(jiān)控。該方法猶如裝上一雙“透視眼”,能即時(shí)監(jiān)測(cè)工業(yè)發(fā)酵罐內(nèi)細(xì)胞代謝功能的變化,快速獲取單細(xì)胞精度的多項(xiàng)關(guān)鍵指標(biāo)。相關(guān)研究近日發(fā)表在國(guó)際學(xué)術(shù)期刊《生物技術(shù)趨勢(shì)》上。

作為封閉的生物反應(yīng)器,發(fā)酵罐可合成各種生物聚合物。如何穿透這個(gè)黑箱實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)細(xì)胞的代謝功能,長(zhǎng)期困擾著生物制造行業(yè)。針對(duì)細(xì)胞中生物聚合物含量與單體組成等關(guān)鍵代謝指標(biāo),傳統(tǒng)過(guò)程分析手段通常需要從罐中取樣、送回實(shí)驗(yàn)室,經(jīng)過(guò)煩瑣的前處理和色譜/質(zhì)譜分析后才有答案,滯后嚴(yán)重。而且,這些滯后的數(shù)據(jù)通常檢測(cè)的是數(shù)百萬(wàn)細(xì)胞的群體平均值,無(wú)法精確鑒別各個(gè)細(xì)胞代謝亞群乃至單個(gè)細(xì)胞的真實(shí)貢獻(xiàn)。
針對(duì)這一行業(yè)瓶頸,研究團(tuán)隊(duì)提出將過(guò)程拉曼組技術(shù)引入發(fā)酵過(guò)程監(jiān)控。他們通過(guò)單細(xì)胞拉曼光譜直接讀取單細(xì)胞生化指紋圖譜,在12分鐘內(nèi)即可同時(shí)獲取單細(xì)胞精度的“正合成什么聚合物、含量多少、單體比例”等多項(xiàng)關(guān)鍵指標(biāo)。這一策略將傳統(tǒng)兩天的檢測(cè)周期壓縮至分鐘級(jí),且能定量監(jiān)控細(xì)胞代謝異質(zhì)性變化,從而指導(dǎo)發(fā)酵過(guò)程的理性調(diào)控。

聚羥基脂肪酸酯(PHA)是一類可生物合成的聚酯類聚合物。研究過(guò)程中,科研團(tuán)隊(duì)建立了過(guò)程拉曼組技術(shù)平臺(tái),實(shí)現(xiàn)了PHA生產(chǎn)過(guò)程在單細(xì)胞精度、免熒光標(biāo)記的代謝表型組監(jiān)測(cè),且可在單細(xì)胞水平同時(shí)定量總PHA含量及其單體組成,精度與傳統(tǒng)氣相色譜方法相當(dāng)。
青島能源所張佳副研究員介紹,目前,5000升工業(yè)發(fā)酵罐實(shí)測(cè)已驗(yàn)證了過(guò)程拉曼組技術(shù)的工業(yè)應(yīng)用價(jià)值。此外,研究團(tuán)隊(duì)還針對(duì)釀酒酵母合成蛋白、紅球菌合成油脂等多種底盤、多種產(chǎn)品,驗(yàn)證了過(guò)程拉曼組技術(shù)平臺(tái)的廣譜應(yīng)用價(jià)值。
下一步,相關(guān)方將協(xié)同采集并比較針對(duì)典型工業(yè)發(fā)酵場(chǎng)景的過(guò)程拉曼組數(shù)據(jù),合作建立新一代發(fā)酵過(guò)程質(zhì)檢質(zhì)控體系。
(研究團(tuán)隊(duì)供圖)
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